Trong cấu tạo sinh học của hạt, chất dinh dưỡng không phân bố đều, mà tập trung chủ yếu tại nội nhũ và phôi – đây là hai bộ phận giúp nuôi mầm non phát triển sau này. Do đó, chất béo, protein, vitamin nhóm B, E, chất khoáng… đều nằm ở những phần này.Điều này lý giải vì sao các loại hạt như macca, óc chó, hạt hướng dương, hạt chia… lại giàu năng lượng và được coi là “siêu thực phẩm” trong dinh dưỡng hiện đại.
Một lưu ý nhỏ là nhiệt độ chế biến cũng ảnh hưởng đến lượng dinh dưỡng giữ lại. Hạt rang quá chín, tẩm muối, hoặc bảo quản sai cách có thể làm mất đi nhiều dưỡng chất quý. Vì vậy, nên chọn hạt sấy thô, ít chế biến, không tẩm vị để đảm bảo giữ được giá trị dinh dưỡng cao nhất.